IBM: Superkomputer na biurku
Francuskie Stowarzyszenie Zwalczania Chorób Mięśni (AFM - Assciation Francaise contre les Myopathies) oraz firma IBM ogłosiły rozpoczęcie wspólnego projektu Decryption, którego oficjalna inauguracja odbędzie się 7-8 grudnia podczas ogólnokrajowej gali telewizyjnej Telethon. Dzięki tej inicjatywie użytkownicy Internetu będą mogli uczestniczyć w ogromnym projekcie naukowym, którego celem jest zmapowanie ponad 500.000 protein.
Stanie się to możliwe dzięki połączeniu niewykorzystywanych możliwości setek tysięcy stacjonarnych komputerów, które stworzą wirtualny, dysponujący ogromną mocą obliczeniową superkomputer. Celem jest uzyskanie bazy danych protein, która pomoże naukowcom oraz organizacjom takim jak AFM w lepszym zrozumieniu przyczyn chorób genetycznych oraz przyspieszy proces tworzenia nowych metod ich leczenia.
Projekt Decryption jest oparty na modelu programowania rozproszonego, w którym programy (przygotowane przez firmę Geomini na podstawie algorytmu Smita-Watermana) są wykonywane jednocześnie na serwerze oraz wielu rozproszonych komputerach PC. Zadaniem aplikacji jest wykonywanie obliczeń i analiz sekwencji protein, na podstawie których możliwe będzie ich wyodrębnianie oraz klasyfikacja.
Naukowcy wierzą, że lepsze zrozumienie biologicznych funkcji sekwencji protein pomoże zrozumieć istotę chorób genetycznych.
Inicjatywa stawia sobie za cel porównanie 500.000 tysięcy znanych ludzkich, zwierzęcych oraz roślinnych protein. Poprzez połączenie w sieć stacjonarnych komputerów PC oraz użycie ich niewykorzystywanej mocy obliczeniowej, AFM oraz firma IBM stworzą ogromny wirtualny superkomputer posiadający moc obliczeniową rzędu 40 teraflopów, co pozwoli na znaczne przyspieszenie tempa analiz.
Aby stworzyć taki wirtualny superkomputer, IBM dostarczy kompletną infrastrukturę IT, składającą się z serwerów, oprogramowania, systemów magazynowania danych oraz dodatkowych usług. Firma IBM będzie obsługiwać infrastrukturę oraz dostarczy otrzymaną bazę danych do partnerów projektu - firmy Geomini oraz AFM.
Aby wziąć udział w projekcie Decryption należy wejść na stronę Telethon, http://www.telethon.fr,wpisać swój adres e-mail wraz z liczbą komputerów PC, które mają zostać udostępnione. W lutym 2002 roku, zarejestrowani Internauci otrzymają e-mail ze wskazówkami jak pobrać darmowe oprogramowanie ze strony www.telethon.fr.
Aplikacje stworzone przez firmę Geomini umożliwią dzielenie się informacjami pomiędzy biorącymi udział w projekcie komputerami za pomocą Internetu. Aplikacje przeprowadzające obliczenia będą działały bez względu na to czy w danej chwili komputer jest podłączony do Internetu. Rezultaty będą przesyłane do serwera w chwili gdy użytkownik wchodzi do Internetu. Uczestnicy projektu nie będą odczuwać zmniejszenia wydajności swych komputerów, gdyż aplikację będą używać tylko niewykorzystaną część mocy obliczeniowej. Przewiduje się, że projekt będzie trwał maksymalnie 7 miesięcy.
www.ibm.com/solutions/lifesciences
